SAK jau kopš 2009.gada ir aktīvi rosinājusi veikt būtiskas pārmaiņas Latvijas augstākās izglītības un zinātnes sektorā. Mijiedarbībā ar valsts pārvaldes iestādēm, kā arī dažādās apaļā galda diskusijās SAK sagatavojusi publiskos ziņojumos un aktīvi piedāvājusi pārveidot sektora finansēšanas un pārvaldības sistēmu. Augstākās izglītības reformēšanas kontekstā SAK veica pētnieciski analītisku darbību un sagatavoja vairākus analītiskus ziņojumus, kuros tiek argumentēti un skaidroti apsvērumi par labu jauna augstākās izglītības finansēšanas modeļa koncepcijai.